A edição 2012/2013 do Novo Basquete Brasil (NBB) será disputada entre 18 equipes em cinco fases. Na primeira, as agremiações jogam entre si em turno e returno. As 12 mais bem classificadas conquistam o direito de avançar à fase de mata-mata, sendo que os quatro primeiros vão diretamente às quartas de final (3ª fase).
Caso clubes terminem a primeira fase empatados na classificação, o desempate será feito da seguinte forma: 1º - confronto direto entre as equipes; 2º - melhor saldo de pontos das partidas entre as equipes; 3º- melhor cesta average nos confrontos entre os times empatados (divisão entre pontos convertidos e sofridos); 4º - melhor cesta average entre todos os confrontos; 5º - Será realizado um sorteio permanecendo o empate.
As equipes que por sua vez terminarem a fase de classificação em 17º e 18º lugares disputarão um quadrangular de ascenso e descenso com os dois times mais bem classificados da Super Copa Brasil. O quadrangular será disputado no sistema todos contra todos, em turno único, e os dois melhores se classificam para a edição de 2013/2014 do NBB.
Na segunda fase, as equipes que terminaram entre a 5ª e 12ª colocação disputam as quatro vagas restantes nas quartas de final. Sempre com o melhor classificado enfrentando o time de pior campanha (5º x 12º, 6º x 11º e assim por diante). Os confrontos serão realizados em melhor de cinco partidas, sendo o clube que vencer três partidas considerado o vencedor.
Em caso de empate na classificação, serão utilizados os seguintes critérios: 1º - confronto direto; 2º saldo de cestas no confronto direto; 3º - cesta average entre os times empatados; 4º - cesta average durante todo o quadrangular; 5º - sorteio.
O regulamento para as demais fases (quartas, semi e final) será o mesmo da segunda fase, com as equipes se enfrentando em confronto melhor de cinco partidas. O critério de time com melhor campanha na primeira fase contra o de pior também será mantido.
Será considerado o campeão da edição 2012/2013 do NBB o vencedor da quinta fase (final). Os primeiros colocados na classificação final ocuparão as vagas destinadas ao Brasil às competições internacionais.