O Parque Nacional cobra uma taxa de US$ 100 aos turistas, mas brasileiros pagam US$ 50, assim como os outros membros do Mercosul. O valor deve ser pago, em dinheiro, no desembarque nos aeroportos. É preciso também pagar US$ 10 nos aeroportos de Quito ou Guayaquil referente à TCT, cartão de controle de trânsito em Galápagos.